Composant essentiel pour la détection et la quantification des OGM via l'ADN, cet instrument utilise la technologie de réaction en chaîne par polymérase en temps réel (qPCR). Cet appareil performant amplifie les traces de fragments d'OGM à des niveaux détectables et mesurables, permettant une analyse précise.
Le Rotor-Gene Q est un thermocycleur de réaction en chaîne par polymérase (PCR) en temps réel fabriqué par QIAGEN. Il est principalement utilisé pour la PCR quantitative (qPCR) et d'autres applications nécessitant un contrôle précis de la température et une détection par fluorescence. En tant qu'outil d'analyse, le Rotor-Gene Q offre plusieurs caractéristiques et avantages clés :
Principe:
- PCR en temps réel :
- La PCR en temps réel, également connue sous le nom de PCR quantitative (qPCR), permet l'amplification et la quantification de cibles d'ADN spécifiques en temps réel pendant le processus de PCR.
- Elle repose sur la détection de la fluorescence émise par des sondes marquées par des fluorophores ou des colorants de liaison à l'ADN au fur et à mesure de la progression de la réaction PCR.
Instrumentation:
- Thermocycleur :
- Le Rotor-Gene Q offre un contrôle précis de la température pour l'amplification PCR, avec des profils de température personnalisables pour s'adapter à divers protocoles PCR.
- Système de détection optique :
- L'instrument est équipé d'un système de détection optique hautement sensible capable de détecter les signaux de fluorescence en temps réel pendant l'amplification PCR.
- Conception du rotor :
- Le Rotor-Gene Q est doté d'une conception de rotor centrifuge, permettant un mélange efficace des composants de la réaction PCR et améliorant l'uniformité de la réaction.
Principales caractéristiques:
- Capacité de multiplexage :
- Le Rotor-Gene Q prend en charge la PCR multiplex, permettant l'amplification et la détection simultanées de plusieurs séquences cibles dans une seule réaction.
- Large plage dynamique :
- Il offre une large gamme dynamique de détection, permettant une quantification précise de l'ADN cible sur une large gamme de concentrations.
- Haut débit :
- L'instrument prend en charge la PCR à haut débit avec la capacité de traiter plusieurs échantillons en parallèle, ce qui le rend adapté aux expériences à grande échelle.
- Intégration de logiciels :
- Le Rotor-Gene Q est généralement accompagné d'un logiciel convivial pour le contrôle des instruments, l'acquisition et l'analyse des données, facilitant ainsi la facilité d'utilisation et l'interprétation des données.
Applications:
- Analyse de l'expression génétique :
- Quantification des niveaux d'expression des gènes dans des échantillons biologiques.
- Détection des agents pathogènes :
- Détection et quantification des agents pathogènes microbiens dans des échantillons cliniques, environnementaux et alimentaires.
- Analyse de la variation génétique :
- Détection de mutations génétiques, de polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) et de variantes alléliques.
- Détermination de la charge virale :
- Quantification des acides nucléiques viraux pour la surveillance de la charge virale dans les maladies infectieuses.
- Quantification microbienne :
- Dénombrement et quantification des populations microbiennes dans des échantillons environnementaux et industriels.
Avantages :
- Haute sensibilité:
- Le Rotor-Gene Q offre une sensibilité élevée, permettant la détection de cibles à faible abondance avec précision.
- Précision quantitative :
- Il fournit une quantification précise des acides nucléiques cibles sur une large gamme de concentrations, ce qui le rend adapté aux analyses qualitatives et quantitatives.
- Rapidité et efficacité :
- La PCR en temps réel réalisée sur le Rotor-Gene Q offre des résultats rapides et efficaces par rapport aux méthodes traditionnelles de PCR en point final.
- Automatisation et intégration des flux de travail :
- L'intégration avec les systèmes automatisés de préparation d'échantillons rationalise le flux de travail et réduit le temps de manipulation, améliorant ainsi l'efficacité du laboratoire.
Défis:
- Considérations relatives aux coûts :
- Le coût d’investissement initial et les dépenses de maintenance continues peuvent être un facteur à prendre en compte pour les laboratoires ayant des contraintes budgétaires.
- Exigences d'optimisation :
- L'optimisation du test PCR peut être nécessaire pour obtenir des performances optimales pour des applications et des cibles spécifiques.
- Complexité de l'analyse des données :
- L'analyse des données pour les expériences de PCR en temps réel peut nécessiter une expertise en bioinformatique et en analyse statistique, en particulier pour les conceptions expérimentales complexes.
Dans l’ensemble, le thermocycleur Rotor-Gene Q est un outil d’analyse polyvalent qui fournit une quantification précise et fiable des acides nucléiques, ce qui le rend indispensable dans la recherche en biologie moléculaire, le diagnostic clinique et divers autres domaines nécessitant une analyse des acides nucléiques.