En simplifiant la purification de l'ADN, le QIACube automatise ce processus autrefois fastidieux d'extraction d'ADN dans les échantillons de test avant les tests d'OGM. Ce système automatisé garantit des résultats reproductibles avec un temps de manipulation minimal, réduisant ainsi les erreurs humaines et renforçant la confiance dans le processus.
Notre laboratoire dispose également d'une capacité d'extraction et d'analyse d'ADN. Grâce à cette capacité, nous pouvons déterminer si un ingrédient a été récolté à partir d'une source génétiquement modifiée.
A vérifier :
Analyse de l'ADN environnemental (ADN environnemental)
L'analyse de l'ADN environnemental (eADN) est une technique qui permet d'étudier la prévalence de différentes espèces de plantes, de champignons et d'animaux dans l'environnement grâce à l'ADN qu'elles y perdent.
Les résidus d'ADN peuvent être extraits d'échantillons environnementaux, notamment d'eau, de sédiments ou de sol. Les échantillons sont collectés dans les filtres conformément au plan d'échantillonnage convenu séparément. Après l'extraction, la réaction en chaîne par polymérase (PCR) est utilisée pour augmenter l'abondance d'ADN dans l'échantillon. L'ADN est ensuite séquencé à l'aide d'instruments de séquencement automatique et comparé à une base de données de séquences d'ADN connues pour identifier l'espèce dont il est issu.
Voici quelques exemples d’applications de test ADN environnemental :
- Surveillance de la présence d’espèces menacées ou envahissantes au sein d’un habitat.
- Évaluation de la qualité du sol en étudiant la prévalence d’espèces indicatrices, telles que les microbes et les champignons.
- Collecte de données pour une évaluation d’impact environnemental avant un projet d’infrastructure à grande échelle afin de minimiser les dommages causés aux espèces vulnérables.
Le prix de l'analyse dépend de l'espèce ciblée et de l'ampleur du projet. Veuillez les décrire en détail lors de votre demande de devis.
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L'extraction et la purification de l'ADN sont des étapes fondamentales de la biologie moléculaire et de la génétique. Elles sont essentielles pour obtenir un ADN de haute qualité pour des applications en aval telles que la PCR, le séquençage, le clonage et d'autres analyses moléculaires. Voici un aperçu général du processus d'extraction et de purification de l'ADN :
Extraction d'ADN :
- Collecte d'échantillons :
- Commencez par collecter le matériel biologique contenant de l'ADN. Il peut s'agir de cellules, de tissus, de sang ou d'autres types d'échantillons.
- Lyse cellulaire :
- Briser les cellules pour libérer les composants cellulaires, y compris l'ADN. Cela peut être réalisé par rupture mécanique, digestion enzymatique ou lyse chimique.
- Dénaturation des protéines :
- Utilisez un agent dénaturant les protéines (tel que le SDS) pour perturber les interactions protéines-ADN et séparer l’ADN des protéines.
- Digestion de l'ARN (facultatif) :
- Traitez l’échantillon avec de la RNase pour éliminer les contaminants d’ARN si de l’ADN sans ARN est requis.
- Précipitation de l'ADN :
- Ajoutez une solution contenant de l’alcool (généralement de l’isopropanol ou de l’éthanol) pour précipiter l’ADN de la solution.
- Collecte de boulettes d'ADN :
- Centrifuger l’échantillon pour recueillir l’ADN précipité dans un culot au fond du tube.
- Laver et remettre en suspension :
- Lavez le culot d’ADN avec de l’éthanol pour éliminer les impuretés, puis resuspendez l’ADN dans un tampon approprié.
Purification de l'ADN :
- Purification par colonnes (colonnes de centrifugation) :
- Utilisez des kits de purification d’ADN commerciaux avec des colonnes de centrifugation contenant des membranes de silice ou d’autres matériaux ayant une affinité pour l’ADN.
- Liez l’ADN à la colonne, éliminez les contaminants, puis éluez l’ADN purifié.
- Extraction de phénol-chloroforme (extraction organique) :
- Procédez à une extraction au phénol-chloroforme pour éliminer les protéines et autres contaminants. Cette méthode nécessite une manipulation prudente des produits chimiques dangereux.
- Précipitation de l'éthanol :
- Précipiter l'ADN en ajoutant de l'éthanol ou de l'isopropanol et en centrifugeant pour recueillir le culot d'ADN. Cette méthode est souvent utilisée après une extraction organique ou comme alternative à la purification sur colonne.
- Électrophorèse sur gel (en option) :
- Effectuez une électrophorèse sur gel d'agarose pour vérifier la taille et la pureté de l'ADN extrait. Cette étape est facultative mais peut être utile pour le contrôle qualité.
Conseils supplémentaires :
- Contrôle de qualité:
- Évaluer la concentration et la pureté de l’ADN à l’aide de la spectrophotométrie (par exemple, UV-Vis) ou de la fluorométrie.
- Vérifiez l’intégrité et la taille des fragments d’ADN par électrophorèse sur gel d’agarose ou d’autres méthodes.
- Stockage:
- Conservez l’ADN purifié à -20 °C ou -80 °C pour une conservation à long terme.
- Automation:
- Les laboratoires à haut débit peuvent utiliser des systèmes automatisés pour l’extraction et la purification de l’ADN afin d’augmenter l’efficacité et de réduire la variabilité.
Suivez toujours les protocoles spécifiques fournis avec les kits ou méthodes d’extraction/purification d’ADN que vous choisissez, car ils peuvent varier en fonction du type d’échantillon et des applications en aval.